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项目文章(Cancer Letters IF:10.1)|从糖代谢到表观遗传:肝癌进展的隐藏引擎

发布时间:2025-11-21
分解率重编写程序是癌肿发生和近展的标记,提子糖分解率的转换起着本质反应。这提升使癌肿癌细胞系也能很快获利电量并所产生必需品的分解率两边体,然后帮助激发生张。虽然还具有必要目的,但癌肿癌细胞系调整糖酵解的体系仍不怎么熟知 。

近日,杭州医科大生1其他大医院王学浩教授团队合作在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向药物能量场分解代谢检测分析服务。

英文音标关键词:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)

中文翻译大标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路

朋友工作单位:南京医科大学

分析建材:细胞

拜谱供给安全服务:转录组测序+蛋白质互作组+靶向药物电能新陈代谢组

工艺线路:

研究方案结果显示

01、YBX1被鉴别为HCC中糖酵解的首要基因组

本的研究收采HCC肉瘤范本(n=7)的单阻止内部核RNA测序数剧集通过探讨,发现了糖酵解活力性重点一起在肉瘤阻止内部核中,hdWGCNA探讨辨认出9个基因组控制器(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的我的世界孤岛生存探讨判定YBX1为人格独立我的世界孤岛生存分险主观因素(图1H)。进一点结合在一起IHC、WB测试和肉瘤阻止与领近非肉瘤阻止的空间区域转录组学数剧集灵魂存在YBX1是肝阻止内部核癌缓解的潜在的靶点(图1I-K)。

图1:YBX1被来确定为设定HCC组织细胞糖酵解的主要原因

02、YBX1加速HCC中的有氧糖酵解和增值能力

为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点消耗的能量分泌组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。

图2:YBX1使得HCC中的有氧糖酵解和增值

03、OGT与YBX1紧密结合并利于YBX1的O-GlcNAc糖基化

为了识别YBX1的调控因子,核蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。

图3:OGT与YBX1融入并带动YBX1的O-GlcNAc糖基化

04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增強其磷碱化,最终得以使得其核转位

进那步判断YBX1的O-GlcNAc糖基化会不会作用其磷过酸,在OGT敲低的HCC内部系中或用OGT能够抑药物OSMI-1加工工作,YBX1血清级别重要缩减,YBX1磷过酸重要极大减少(图4A-C)。IP实践显示信息,在不同的Flag-YBX1底物级别下,YBX1-WT的磷过酸级别重要少于YBX1-T57A,表明磷过酸的上升既仅是为了更高一些的YBX1血清表现(图4D)。分割了核和质混合物表明TMG加工工作的HCC内部系中YBX1核表现的增高(图4E-F),进那步表明YBX1磷过酸的最为关键的调整细胞是AKT(图4G-I)。以上表明着重于O-GlcNAc糖基化顺利通过力促会其磷过酸来明显增强YBX1血清安全性并力促会核转位。

图 4.YBX1的 O-GlcNAc 装饰语有好处于其进的一步發生磷酸性反应装饰语并可能提高网站其核转位

05、YBX1利于PKM2转录

前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。

图 5.YBX1有利于PKM2转录

06、YBX1 够改善组蛋白质乳硝化作用修饰语情况

探索知道YBX1敲低有效减轻了淀粉酶质乳酸性反应,尤其要是H3K18乳酸性反应(图6A-C)。糖酵解可抑注射剂2-DG的实验操作声明了糖酵解与组淀粉酶乳酸性反应的可以可以绑定qq,可遏制糖酵解可有效减轻了H3K18la关卡(图6D)。PKM2过传达不可逆转转YBX1敲低所导致的的H3K18la下滑,到外源乳酸操作不仅能提高H3K18la,还随着YBX1传达上涨,的提示存在着单向意见反馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR声明,H3K18la能够生物富集于YBX1开机启动子可以可以催进其转录,该进程受O-GlcNAc糖基化房产调控(图6H-J),并知道P300 上涨是YBX1资料H3K18乳酰化做用的系统(图6K-L)。

图6.YBX1强化H3K18乳碱化装饰含量

文章内容工作小结

在一些调查中报导了YBX1在HCC中高体现出来,并与糖酵揭秘切有关。YBX1在T57处被O-GlcNAc突显语,于是保持稳定氨基酸质并加入其体现出来。一些突显语还加速YBX1在T57处的磷碱化,加速其核易位。于是,这种过程中增加了糖酵解有关什么是染色体的转录并促使乳酸的出现。不仅,YBX1刺激P300的转录,继而驱动下载组氨基酸的乳碱化,独特是H3K18la,H3K18乳碱化同向监测YBX1什么是染色体转录(图7)。

图7.Y糖酵解-表观基因遗传规律正反两面馈环工作机制图

拜谱工作小结

本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱海洋生物为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶点力量产生组技术服务,拜谱生物工程建立了完善成熟的转录组学、蛋白质组学、译文资料后体现组学、消化吸收组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!

学习学术论文

Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.
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