代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
物质判定：分解转化组学工艺要能对中补品中的物理化学上的物质实现全面的探讨，判定出补品中的生物物质。随后，运用体系结构质谱（MS）的分解转化组学工艺，能否判定出山参中的山参皂苷等生物物质。这个工艺还能否分入药价值和非入药价值那部分的物理化学上的标上物，为中补品的重量设定带来了法律规定。
质理管理调控：完营养组分解组学的技术，会对中草药的质理管理参与监测和调控。比如说，灵活运用树种分解组学研究分析，会规划设计重要性类风湿骨痛性髋风湿病的中草药营养组分的质理管理标记图片的酶联免疫法手段。虽然，分解组学还会正常识别系统中草药中的渗透性营养组分以及其渗透性新机制，如完成UPLC-Q-TOF-MS研究分析，辩别有差异 乌头树种的物理化学营养组分，并正常识别系统有着镇疼吸附性和亚急性渗透性的海洋生物碱。
2. 中药药效机制研究
的用处靶点认别：分泌组学技術行帮忙认别中草药活性酶类部分的氧分子靶点。列如 ，研究方案看到雷公藤红素可凭借调控Treg/TH1和Treg/Th17均衡、抑制NF-κB径路等长效机制发挥用处消除炎症的用处。
功效制度诠释：消化吸收组学水平是能够 体现了成药配方医治病毒的功效制度。假如，调查显示青蒿素抗药与疟原虫的线粒体消化吸收修改业内，非靶向疗法消化吸收组学体现了了与该时候各种相关的消化吸收物发生改变。虽然，消化吸收组学还能够 经由介绍消化吸收物的发生改变，调查成药配方复方的功效制度。
3. 中药安全性评价
致毒体系研发方案：分解产生组学技艺能够用做研发方案中药才的致毒体系。如，完成分解产生组学和16S rDNA测序的聚合探讨，揭露了清益汤对危重突然胰腺炎有关的突然肺神经损伤的庇护体系，并确实了铁处变不惊、异同分解产海洋生物和微海洋生物菌群左右的相互影响。
安全管理保障保障性评定：消化吸收组学技术性还能否广泛用于中草药的安全管理保障保障性评定，甄别不确定的渗透性组成和渗透性靶点，而为中草药的安全管理保障保障运行给予科学实验数据。
4. 中医证候研究
证候对应产微生物了解：产生组学高技术就可以于表现与医学师证候对应的内源性产微生物变幻，辅助软件医学师证候的评估和调控。列举，使用产生组学的研究，已在冠烦扰之处提高中技术鉴定出与痰瘀证随和阴两虚证对应的微生物标识物。
证候纠正调查：分泌组学方法还都可以用到调查药材对中医医生证候的纠正体验。举例，借助分泌组学方法及聚类解析解析法，发展“黄芪-茯苓-泽泻”等有关的联药剂选择适用人群到肾病综上征的新组方药剂，就能够对各种肾病综上征有关的的怪物图标物所产生关系。
5. 多组学技术整合应用
两组学聚合：分泌组学与另外组学工艺（如染色体组学、转录组学、血清质组学等）的聚合运用，为中草药钻研给予好几回个多基本要素的分享方框。各种聚合运用不只加强了我们的对中草药组成成分在氧分子基本特征上对人体本身身体和病症动态的用途，还有为具体分析中草药的用途体系和疗效产物基础条件给予了强力量的的工具。
重大疫情改善缘由：多个学技术设备可能采用科学研究药材改善重大疫情的分子式缘由。举例，根据蛋清质含量质组学和产生组学的携手使用，表明了与中医理论划分类别的膝肘膝盖骨性肘膝盖炎紧密联系相关内容的不同之处描述蛋清质含量和产生环路。
新陈代谢组学技术运用在草药深入分析中的运用，为草药的新数字化和精淮医辽提供数据了必要的科学性能够，这样有利于推进草药的规格化和知名化成长 。