
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱菌物 为其提供 TMT淀粉酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
科学研究导致
钻研人数探究性根据冷冻的时间间隔增长时间间隔牛羊肉片的抗拉强度、持水利、光亮感、自由铁的含量、ROS、脂质过钝化物、MDA、GSH和GPX4平均水平来评定手臂肌肉公司体细胞系的铁牺牲状况。效果展现,冷冻的时间间隔增长时间间隔后,牛羊肉片的抗拉强度在第3天和第6天相关系数骤降;持水本事降低;色泽变深,失去了光亮,鲜橙粉红色调成暗橙粉红色。因此,自由铁、亲水性氧和MDA的的含量相关系数新增,体细胞系凋亡率相关系数提高。 探析师获取各种要在冷藏室保存期间的腿部脂肪样件的血清质,并且通过SDS-PAGE浅析,血清质条带在各种期间分布点一致且相近(图1a)。选择血清在各种样件中的表达方法环境,浅析会发现同样一组样件的中四位数相关性于同样一层次(图1b),表明腿部脂肪样件血清质都具有稳定的组内相近性和组间不一致性性。 血清质组学共签定出1996种血清质。以B0为照表组,筛分B1、B2、B4和B6中的血清使用不同之处性抒发了解,共签定到37七个DEPs。将火山图多维数据分析,并通过FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05这两个要求了解DEP。可是如同1c-f右图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别签定出22、33、73和140个DEPs,其中的分刘海别上涨6、11、32和815个,调低16、22、41和5两个。聚类分析的方式评估报告格式了多种速冻价段身体肌策划 中血清质的抒发,可是表明身体肌血清抒发不同之处性渐渐贮藏时光的增大而增大(图1g)。
图1| 不一冷藏库时间间隔的肩部肌肉样品英文球营养物质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各个冷冻箱耗时的脂肪原辅料不同淀粉酶分析一下(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死亡视频蛋白质肽的PRM降钙素原检测了解(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 针对KEGG丰度相互影响展示血清的铁消失制度(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人心得体会
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱动物提供了TMT降钙素原检测血清质组学技能精准服务管理,拜谱菌物已研制开发达成并树立了完整成熟稳定的转录组学、血清组学、消化吸收组学各种两组学携手厂品技能精准服务管理体制,欢迎致电咨询!
参看文献资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.